《表2 CAⅢ蛋白质的亚细胞定位预测》

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《猪CAⅢ基因CDS区克隆、生物信息学及组织表达分析》

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疏水性预测分析结果如图3所示，CAⅢ蛋白在143位点有最大值2.744，疏水性最强；在13和14位点有最小值2.556，亲水性最强，且亲水性蛋白多于疏水性蛋白，推测CAⅢ基因编码的蛋白质多肽链是亲水性蛋白，与蛋白质理化性质预测的结果一致。对CAⅢ蛋白的序列进行信号肽预测（图4），得到C值（剪切位点值）为0.108，Y值（Y-max是综合考虑S值和C值的一个参数）为0.102，S值为0.121，D值（S-mean和Y-max的平均值）为0.107，CAⅢ蛋白在Y值曲线没有出现峰值，S值<0.5，说明CAⅢ蛋白很可能不存在信号肽。蛋白修饰磷酸化位点预测，当潜在磷酸化位点的阈值为0.5时，该位点存在磷酸化位点，则CAⅢ蛋白潜在的磷酸化位点有丝氨酸19个位点，苏氨酸3个位点，酪氨酸12个位点（图5）。亚细胞定位预测结果显示，CAⅢ蛋白主要分布在细胞质，其次是细胞核，在过氧化物酶体和线粒体中也有分布（表2），由此推断，CAⅢ蛋白主要在细胞质中发挥生物学作用。对CAⅢ蛋白的二级结构预测结果表明，该蛋白α-螺旋区域有39个氨基酸，占15%；参与形成延伸链的氨基酸有68个，占26.15%；β-转角区域有13个氨基酸，占5%；参与形成无规则卷曲的有140个氨基酸，占53.85%（图6）。三级结构预测结果显示，CAⅢ蛋白由α-螺旋、β-转角以及无规则卷曲等一系列复杂的过程形成了一个稳定的结构（图7）。