《表1 烟草PPO蛋白序列的亚细胞定位》

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《烟草PPO蛋白序列的生物信息学分析》


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注:Len表示序列长,cTP表示叶绿体转运肽,mTP表示线粒体靶向肽,SP表示信号肽,other表示其他位置,Loc表示定位结果,RC表示可靠性等级。

通过序列比对分析(图3),Nt PPO2和Nt PPO3序列相对较短,烟草PPO蛋白序列在N端存在差异,而中间区域和C端相似度较高,及从第92位氨基酸开始无明显差异,主要于第110、242和334位有所不同。通过对烟草PPO进行亚细胞定位,有利于了解其在特定位置发挥作用,因此对烟草PPO成员进行亚细胞定位,结果如表1所示。Nt PPO1、Nt PPO2和Nt PPO3均含有信号肽的信号,分别为0.013、0.012和0.069,尽管Nt PPO1和Nt PPO2信号强度较为微弱,通过定位结果Nt PPO1可能位于线粒体,其概率达到92.8%,可靠性达到2级;Nt PPO2定位结果与Nt PPO1相同,即位于线粒体,概率为95.4%,其可靠级别为1级,可靠性最强;对于Nt PPO3,其具有较强的信号强度,但经过亚细胞定位,Nt PPO3不属于在线粒体和叶绿体中发挥作用的蛋白质,可能位于其它亚细胞结构中发挥作用,其概率为81.4%,可靠级别仅为3级。