《表4 西红花MADS-box转录因子蛋白导肽预测》

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《西红花MADS-box基因家族的生物信息学分析》

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导肽（Leader peptide）是一段N-端长约20～80个氨基酸的短肽链，其在游离核糖体上合成，能够发挥引导新合成的肽链进入细胞器的功能（薛永常等，2009）。对导肽是否存在进行预测分析，对进一步研究目的蛋白的功能、深入解析其在体内的作用机制和作用途径具有非常重要的意义（龙芳等，2013）。利用在线分析软件TargetP 1.1 Server对西红花MA-DS-box蛋白进行预测，结果显示，Cs MADS01和CsMADS03有线粒体转运肽，定位在线粒体，CsMADS06和Cs MADS07有叶绿体转运肽，定位在叶绿体，但置信等级都大于3（表4），表明上述蛋白定位并不是很确切。其余13条MADS-box蛋白并不含有导肽。信号肽预测和跨膜结构域预测结果显示，Cs MADS-box既不含有信号肽，也不具有跨膜结构特征，因信号肽是引导靶标蛋白跨膜转运的氨基酸序列（Petersen et al.，2011），二者结果一致，说明预测结果的合理性。同时亚细胞定位预测结果表明，所有的Cs MADS-box均定位在细胞核，说明Cs MADS-box蛋白作为转录因子，不进行蛋白转运，直接在细胞核中发挥转录调控作用。这一结果与菠萝MADS-box的预测结果相同（胡加谊等，2017），也符合MADS-box家族转录因子成员的特点。