《表4 转录因子与靶基因结合位点预测》

《表4 转录因子与靶基因结合位点预测》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《金铁锁转录因子ptMYC2的克隆和生物信息学分析》


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MYC类转录因子对目的基因的调控,是通过与目的基因启动子的E-box特异性结合域的结合实现的。由于金铁锁还未进行过全基因组测序,本研究通过Blast软件对金铁锁三萜皂苷合成途径上的关键酶基因HMGR、SE、FPS、β-AS分别进行相似性搜索,其中,金铁锁HMGR的基因序列与胡杨(Populus euphratica)的相似性最高,SE1与甜菜(Beta vulgaris subsp.)的相似性最高,SE2、FPS、β-AS的序列与藜麦(Chenopodium quinoa)的相似性最高,分别下载相似性最高物种基因上游2 000 bp的区域作为该基因的启动子序列(启动子序列见附录),分析预测可能与ptMYC2互作的靶基因及结合信息位点,结果如表4所示。