《表3 猕猴桃fasciclin基因启动子区结合位点预测(Threshold P-value≤1e-7)》
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《中华猕猴桃fasciclin基因家族生物信息学分析及克隆》
猕猴桃38个fasciclin基因共预测到被鉴定的110个TFs的479个结合位点,按P-value由小到大排列,前3位TFs为BBR-BPC、TALE和AP2,9个基因没有预测到TF结合位点,9个fasciclin基因可能发生了沉默。已有研究表明,BBR-BPC结合因子中BPC在所有的花器官中都有表达,尤其是在胚珠中表达量高,BBR是特征性的核定位信号(NLS)序列,在C端延伸至90个氨基酸的DNA结合结构域和一个假定的N端激活结构域。BBR在烟草中的过度表达可以导致叶片形状的显著改变[9]。TALE转录结合因子可控制分生组织的形成和维持,在器官形态发生、器官位置以及生殖期等多个方面起作用[10]。AP2家族转录结合因子的蛋白参与与生长发育相关的多种生物过程的转录调控以及植物对环境刺激的各种反应,AP2家族的基因参与了发育过程的调控,如花的发育、小穗分生组织的确定、叶表皮细胞的鉴定和胚胎的发育[11]。这3种TFs都与植物的性别发育有关,说明该基因家族与植物的性别发育密切相关(表3)。
图表编号 | XD00155505000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.10 |
作者 | 周婉莹、曲东、张晓娟、张文慧、刘艳飞、张羽 |
绘制单位 | 陕西理工大学生物科学与工程学院、陕西理工大学生物科学与工程学院、陕西理工大学生物科学与工程学院、安康市农业科学研究院、西北农林科技大学园艺学院、陕西理工大学生物科学与工程学院 |
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