《表3 BSP启动子转录因子结合位点预测》

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《蛋鸡BSP基因启动子鉴定与分析》

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RUNX:Runt相关转录因子；TCF:T细胞因子；Klf4:Krüppel样因子4；Hoxb6：同源盒B6；Atf3：激活转录因子3；MyoD1：成肌分化抗原1；EGR：早期生长反应因子；+：正义链；-：反义链

根据碱基缺失导致转录因子结合位点的变化，利用数据库http://jaspar.genereg.net/对Hap1和Hap5序列中转录因子结合位点进行预测。候选转录因子为骨代谢相关转录因子，包含RUNX （runtrelated transcription factor）家族、T细胞因子（T cell factor，TCF）家族、Krüppel like factors 4 （Klf4）、同源盒B6 （Hoxb6）、激活转录因子3 （activating transcription factor 3，Atf3）、成肌分化抗原1 （myogenic differentiation antigen 1，Myo D1）和早期生长反应因子（early growth responsive factor，EGR）家族等。由表3可知，不同单倍型预测的BSP启动子转录因子结合位点不同，其中Hap1在-797～-707 bp预测的转录因子结合位点有4个RUNXs、3个TCFs、1个Hoxb6和1个Klf4，在-548～-369 bp预测的转录因子结合位点为TCF3、Atf3、EGR1和Klf4各1个，在-132～-123 bp预测的转录因子结合位点为1个Klf4，在-82～-29 bp预测的转录因子结合位点为5个EGRs、2个Klf4和1个Myod1；Hap5在-680～-671 bp预测有1个Klf4转录因子结合位点，在-252～-231 bp预测有7个Klf4和2个eor1转录因子结合位点，在-129～-120 bp预测有2个TCF转录因子结合位点。