《表1 WY172启动子上游2K序列含有的转录因子结合位点》
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《橡胶树白粉菌(HO-73)启动子WY172不同长度片段的克隆及表达活性分析》
在线数据库EPD确认未发现与WY172同源的启动子。对转录因子的预测分析结果显示WY172启动子上游2K序列上共有转录因子结合位点17个(表1),运用IBS软件绘制基因图谱(图1),直观地展示出各个转录因子结合位点在基因上的位置,为后续缺失突变位置的确定提供参考。根据转录因子结合位点在序列上的分布位置,以不切断转录因子结合位点为原则,设计了4个缺失突变片段,分别为WY172Q(2 250 bp)、WY172Q1(1 551 bp)、WY172Q2(1 281 bp)和WY172Q3(871 bp)(图2)。结合前期研究得到的WY172启动子(251 bp),通过Primer Premier 5软件设计了6个引物(表2)。PlantCARE软件分析结果(表3)显示,其上游2K序列含有丰富的作用元件,包括光响应元件、脱落酸响应元件、生长素响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、创伤诱导元件、厌氧感应元件、参与栅栏叶肉细胞分化的元件及玉米蛋白代谢调节的顺式作用元件等。
图表编号 | XD00123664800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.26 |
作者 | 殷金瑶、王义、徐良向、朱利、王晨、刘文波、缪卫国 |
绘制单位 | 海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室、海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室、海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室、海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室、海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室、海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室、海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室 |
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