《表4 突变前后江口萝卜猪UCP2基因转录因子结合位点的预测结果》

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《江口萝卜猪UCP2基因启动子变异分析》

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利用3种不同的生物信息学分析软件对江口萝卜猪UCP2基因启动子突变前后的转录因子结合位点进行预测，具体预测结果详见表4。其中，TFsitescan预测发现，T-366>A突变会导致-370 bp处有1个转录因子结合位点消失，G-161>C突变会导致-166 bp和-164 bp处2个新的转录因子结合位点产生；AliBaba2.1预测发现，3个SNPs位点的突变会导致1个转录因子结合位点改变，并产生5个新的结合位点（图4)；LASAGNA-Searching 2.0预测发现，3个SNPs位点的突变会导致1个高分结合位点消失、3个高分结合位点产生。说明从江口萝卜猪UCP2启动子上筛选到的3个SNPs位点均能不同程度地造成转录因子结合位点改变，促使UCP2基因转录因子结合效率增高。