《表2 江口萝卜猪STAT3基因SNP位点的等位基因频率》

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《江口萝卜猪STAT3基因多态性及生物信息学分析》

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扩增产物送至生工生物工程（上海）股份有限公司进行双向测序，然后通过DNASTAR和BLAST等在线分析软件与参考序列进行比对分析，发现其高度同源性，并筛选出7个SNPs位点（图2）。将各外显子的第1个碱基定义为+1，则这7个SNPs位点分别为:Exon2-A19>C、Exon2-G20>C、Exon2-G74>A、Exon4-T81>A、Exon5-G57>A、Exon5-C64>A和Exon22-C43>A。其中，Exon2-G74>A、Exon4-T81>A和Exon5-G57>A为同义突变，不会引起编码氨基酸改变，但由于存在简并密码子且使用频率不同，也可能会导致基因的表达差异；Exon2-A19>C、Exon2-G20>C、Exon5-C64>A和Exon22-C43>A为错义突变，可导致其mRNA编码氨基酸改变，具体表现（表2）:Exon2-A19>C突变导致丝氨酸突变为精氨酸（Ser→Arg），Exon2-G20>C突变导致丝氨酸突变为苏氨酸（Ser→Thr），Exon5-C64>A突变导致谷氨酰胺突变为赖氨酸（Gln→Lys），Exon22-C43>A突变导致脯氨酸突变为谷氨酰胺（Pro→Gln）。