《表5 突变前后江口萝卜猪UCP2基因启动子CpG岛的预测结果》

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《江口萝卜猪UCP2基因启动子变异分析》

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以Obs/Exp值大于0.6，GC含量大于50.0%和CpG岛范围大于200 bp为标准，采用Webgene、MethPrimer、EMBOSS Cpgplot和Softberry等4种不同的生物信息学软件预测江口萝卜猪UCP2基因启动子突变前后的CpG岛，均发现有CpG岛存在（表5）。其中，MethPrimer和EMBOSS Cpgplot的预测结果一致，在相同位置（-1476～-1264 bp和-1164～-698 bp）发现2个CpG岛（图5）。虽然4个生物信息学分析软件所预测到的CpG岛大小和位置不完全相同，但在-1200～-700 bp的区域内4个生物信息学分析软件的预测结果均表明极有可能存在1个CpG岛。从江口萝卜猪UCP2启动子上筛选到的3个SNPs位点均不在预测得到的CpG岛内，且不会影响UCP2基因启动子的甲基化水平，说明SNP位点以此调控基因表达的可能性较小。