《表4 人HCN1基因启动子预测结果》

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《人超极化激活环核苷酸门控通道1基因启动子区及蛋白的生物信息学分析》

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启动子区预测和分析参数设置：N e u r a l Network Promoter Prediction[16]启动子阈值设为0.8，Promoter 2.0[17]和TSSG[18]采用默认值。在UCSC数据库中获得人HCN1基因5'上游-1～-2 000 bp的序列，用3种不同的在线软件对2 000 bp序列进行潜在的启动子区预测分析，TSSG未发现启动子区，余结果见表4。将人HCN1基因5'上游2 000 bp序列与Genecopoeia网站查询到的人HCN1基因启动子序列HPRM49983（产品编号）用BLAST工具作全序列对比，发现两者的一致性为51%。HPRM49983全1 289 bp，转录起始位点（TSS）位于1 285 bp的C碱基处。HCN1基因5'上游2 000 bp序列的979～2 000 bp与HPRM49983序列完全一致。由此推测HCN1基因启动子位于5'上游1 100 bp序列内。