《表1 不同物种HCN1蛋白进化距离》

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《人超极化激活环核苷酸门控通道1基因启动子区及蛋白的生物信息学分析》

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人HCN1基因位于5号染色体的短臂上（5p12），编码890个氨基酸，具体位置为chr5:45254948-45696380，包含8个外显子。利用DNAMAN 8.0软件对10个物种的蛋白序列进行同源性比对发现，人HCN1蛋白与黑猩猩、马、猪、牛、狗、褐家鼠、小鼠、鸡和热带爪蟾中同源蛋白的相似度分别为96.74%、96.74%、96.07%、95.84%、92.62%、91.87%、91.87%、85.96%和75.62%。用MEGA7软件[4]中基于序列同源性的邻接法（Neighbor-joining，NJ）构建HCN1蛋白遗传进化关系树（图1），从进化树中可观察到，在进化过程中，人与黑猩猩的亲缘关系最近。小鼠与褐家鼠的亲缘关系较近，聚为一类。其他物种的亲缘关系都较远。不同物种HCN1蛋白进化距离分析结果显示，人与黑猩猩的遗传距离最小，为0.019；与热带爪蟾的进化关系最远，遗传距离为0.182（表1）。人HCN1蛋白在哺乳动物的同源蛋白相似度比较中均>90%，可见该蛋白序列保守性较高。