《表3 库里亚藻不同物种间基于ITS区序列的遗传距离》
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《中国西沙群岛底栖甲藻热带库里亚藻(Coolia tropicalis)的形态学、系统发育及毒性研究》
对基于ITS区段序列的系统发育分析,结合从Genbank上获得的Coolia属的23个已发表序列及2个外类群,共29个序列进行比对分析。由于GenBank中只有少数序列可供比对使用,基于ITS区序列构建的系统发育树总体上支持LSU的结果,但系统发育树的综合性不够全面,有待进一步完善(图6)。本研究中4个西沙群岛热带库里亚藻株系与其余来自世界各地的热带库里亚藻株系聚类在一起形成单一进化枝,支持率为99/1。本研究中的4个序列间存在差异,在系统发育树中可以看到2XS73株更早的与热带库里亚藻的其他株系分离开,形成单一子分支,支持率为99/1;而其余三个株系进入另一分支中。其中XS554与3XS45两条序列的碱基组成无差异,与西班牙株(KR605300、KR605299)和中国株(MF805767)聚集在同一子分支中,支持率为60/1;5XS15与XS554、3XS45株系存在9个碱基差异,也与该分支中其余株系分离开,形成单一子分支,支持率为92/1;另外,2XS73与XS554、3XS45的序列差异为36个碱基,与5XS15的序列差异为40个碱基。热带库里亚藻分支中也显示了一定程度的种内差异,平均遗传距离为0.019,其中西沙群岛株系间的最大遗传距离为0.097(5XS15/2XS73)。基于ITS rDNA序列的库里亚藻种间平均遗传距离为0.128(C.monotis×C.malayensis)至0.798(C.palmyrensis×C.canariensis)(表3)。
图表编号 | XD00168783300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.01 |
作者 | 黄丽芬、李群、吕颂辉、张亮、谢学东 |
绘制单位 | 暨南大学赤潮与海洋生物学研究中心、暨南大学赤潮与海洋生物学研究中心、暨南大学赤潮与海洋生物学研究中心、广东省环境监测中心、广东省环境监测中心 |
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