《表2 库里亚藻不同物种间基于LSU rDNA序列的遗传距离》
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《中国西沙群岛底栖甲藻热带库里亚藻(Coolia tropicalis)的形态学、系统发育及毒性研究》
对基于LSU rDNA序列的系统发育分析,研究获得了4株热带库里亚藻部分大亚基(L S U)rDNA(D1-D3)序列,结合从Genbank上获得的库里亚藻属的39个已发表序列及2个外类群,共45个序列进行比对分析。基于LSU(D1-D3)rDNA基因的系统发育树显示所有序列形成了7个清晰且支持值良好的分支:C.tropicalis、C.palmyrensis、C.malayensis、C.monotis、C.santacroce、C.canariensis和C.guanchica(图5)。本研究中4个西沙群岛热带库里亚藻株系与同种类来自世界各地的其他热带库里亚藻株系聚类在一起形成单一进化枝,支持率高达99/1。本研究中的4个株系序列存在较小差异,分别聚类在3个不同的子分支中,热带库里亚藻株系间遗传距离最大为0.042(5XS15/2XS73)。其中,XS554与3XS45两条序列的碱基组成无差异,与澳大利亚株(HQ897276、MH319016、MH319017)、泰国株(AB908159)和印度尼西亚株(AM902740)聚集在同一子分支中,支持率为99/0.73;5XS15与XS554、3XS45的序列间存在10个碱基差异,与中国香港株系(KX589144、KX589145)聚集在同一子分支中,拥有较高的支持率(99/1);2XS73与马来西亚株(JX896691)和澳大利亚株(MH319018)聚集在同一子分支中,支持率为73/1。另外,2XS73与XS554、3XS45的序列差异为31个碱基,与5XS11、5XS15的序列差异为38个碱基。热带库里亚藻分支中显示了一定程度的种内差异,平均遗传距离为0.02。基于LSU rDNA序列的库里亚藻种间平均遗传距离为0.086(C.monotis×C.santacroce)至0.450(C.tropicalis×C.monotis)(表2)。
图表编号 | XD00168783400 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.05.01 |
作者 | 黄丽芬、李群、吕颂辉、张亮、谢学东 |
绘制单位 | 暨南大学赤潮与海洋生物学研究中心、暨南大学赤潮与海洋生物学研究中心、暨南大学赤潮与海洋生物学研究中心、广东省环境监测中心、广东省环境监测中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |