《表1 青海湖裸鲤AP-1氨基酸序列比对和系统进化树所用物种信息》

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《青海湖裸鲤AP-1基因的克隆与表达分析》

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利用青海湖裸鲤AP-1基因所编码的氨基酸序列在NCBI上进行BLAST比对找到与之同源性较高的鱼类及哺乳动物（表1），利用Clustal Omega软件和序列处理在线工具（SMS）进行氨基酸多序列对比（图4）。BLAST结果显示青海湖裸鲤与犀角金线鲃的同源性高达95.35%，其次为鲤鱼（Cyprinus carpio）（95.02%），与斑马鱼（Danio rerio）的同源性为90.91%。利用MEGA7.0软件构建基于AP-1氨基酸序列的系统进化树（图5），结果显示青海湖裸鲤与模式生物斑马鱼聚为一支，表示两者的亲缘关系最近。其次，金线鲃属鱼类（犀角金线鲃(Sinocyclocheilus rhinocerous），滇池金线鲃（Sinocyclocheilus grahami），安水金线鲃（Sinocyclocheilus anshuiensis）、鱇白鱼（Anabarilius grahami）、颌鱼（Paramormyrops kingsleyae）、鲫鱼（Carassius auratus）、鲤鱼（Cyprinus carpio）聚为一支，与青海湖裸鲤有较近的亲缘关系。而人（Homo sapiens）、鼠（Mus musculus）、牛（Bos taurus）、猪（Sus scrofa）等动物聚为一支，与青海湖裸鲤有较远的亲缘关系。