《表2 多重序列比对和系统进化树构建所用序列》

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《香鱼(Plecoglossus altivelis)JNK1基因克隆及其在成熟卵过熟进程中的表达变化》

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对获得的香鱼JNK1基因cDNA序列，利用ORF Finder（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/orfig.cgi）检测开放阅读框（open reading frame，ORF）并翻译所编码的氨基酸序列；对预测的编码蛋白用SignalP 4.1Server（http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP）进行信号肽预测，用Predict Protein（http://www.predictprotein. org）、NCBI Conserved domains（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi）和Prosite（http://prosite.expasy.org）进行酶活性位点、基序及功能域分析；用Bioedit 7.0软件将香鱼JNK1氨基酸序列与GenBank中的其他物种的JNK1序列进行多重序列对比与同源性分析，并用MEGA5.0软件构建系统进化树。所用序列信息见表2。