《表2 用于序列比对和系统进化树构建所用物种的信息》

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《花鲈b2m基因cDNA的克隆及表达分析》


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用DNAMAN软件对不同物种B2m蛋白的氨基酸序列进行多重序列比对(图2,表2)。花鲈B2m与大黄鱼的相似度最高(63.20%),与齿舌鲈、半滑舌鳎、斑马鱼、智人(Homo sapiens)、草原田鼠(Microtus ochrogaster)的相似度分别为48.80%、48.00%、45.60%、38.40%、36.80%。比对发现共有19个氨基酸位点完全一致,均含有2个高度保守的半胱氨酸残基,其间可形成分子内部二硫键。比对的所有B2m蛋白均含有1个与免疫功能相关的免疫球蛋白样结构域(Immunoglobulin c1-Type,Igc1,图2)。