《表1 用于序列比对和系统发育分析的物种信息》
将蕙兰CyfaSTK基因ORF编码的转录因子在NCBI中进行BlastP(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)同源搜索。本研究选取了23种植物,共30个C/D类MADS转录因子(表1),采用MEGA5.0软件的邻接法(Neighbor-Joining)构建分子系统发育树(Bootstrap=1000)。同时选取文心兰OMADS2、球花石斛Dthyr AG2、小兰屿蝴蝶兰(Phalaenopsis equestris(Schauer)Rchb f.)Pe MADS7、麝香百合(Lilium longiflorum Thunb.)LMADS2、拟南芥STK、连香树(Cercidiphyllum japonicum Sieb.etZucc.)Ceja AGL11、桃(Prunus persica(L.)Batsch.)PPERSTK、苹果(Malus domestica Mill.)MDMADS10和蕙兰CyfaSTK,共9种已知结构域的D类MADS转录因子,采用Bioedit 7.0.9软件的ClustalW程序(Bootstrap=1000),通过蛋白序列同源比对对蕙兰CyfaSTK转录因子的结构域进行分析。
图表编号 | XD00107337500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.01 |
作者 | 费越、夏胜应、熊海燕、刘志雄 |
绘制单位 | 长江大学园艺园林学院、长江大学园艺园林学院、江陵县住房和城乡建设局、长江大学园艺园林学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |