《表1 用于系统发育分析的基因序列》
利用CTAB法提取菌丝的基因组DNA。使用通用引物对ITS4和ITS5(White et al.,1990)、EPG-specific和EPG-3b引物对、OPA2-1L和OPA2-1R引物对(Peever et al.,2005)、Alt-for和Alt-rev引物对(Hong et al.,2005)分别对真菌DNA的核糖体基因转录间隔区(r DNA-ITS)、多聚半乳糖醛酸内切酶基因endo PG、基因组匿名区序列OPA2-1、主过敏原基因Alt a 1进行扩增。PCR扩增体系:10×PCR buffer 2μL,Mg2+(25 mmol·L-1)1.2μL,DNA 100~300 ng,上下游引物(10μmol·L-1)各1μL,d NTPs(2.5 mmol·L-1)0.5μL,Taq DNA聚合酶(5 U·μL-1)0.5μL,无菌水补齐到20μL。PCR反应程序为:94℃预变性5 min;95℃变性30 s,55℃或57℃复性30 s,72℃延伸1 min,30个循环;72℃延伸5 min。PCR扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,通过胶回收、TA载体克隆,送往上海生工进行序列测定。序列交NCBI数据库进行Blast N同源性比对,并登录Gen Bank(表1)。将确定种的序列(表1)与目标序列进行比对,根据Chen等(2016)中的方法进行多基因联合分析,利用软件Phylo Suite(Zhang et al.,2020)构建贝叶斯进化树。
图表编号 | XD00215469700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.25 |
作者 | 陶航、扎依娜·玛合巴提、张烨、孙李瞳、黄沈鑫、张子辉、刘旺、施宁雪、陈孝仁 |
绘制单位 | 扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院、扬州大学园艺与植物保护学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |