《表1 用于ML系统发育树的相关菌株信息及其基因登录号》

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《树莓类拟盘多毛孢叶斑病病原菌的鉴定》


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对代表菌株的ITS、β-tublin和tef1进行了PCR扩增,分别得到了521 mbp、446 mbp和1046 mbp片段。将代表菌的ITS序列放入NCBI中比对,结果表明共与N.megna的ITS序列相似度达100%,再次从属水平上证明该菌属于新拟盘多毛孢属。进一步采用三基因联合建树方法将代表菌与拟盘骨架树上各分支部分代表模式菌株进行比对分析,结果表明该菌与N.aotearoa和N.piceana位于同一分支(结果未在此文提供),该步骤找到了该菌在系统骨架树上所处的具体分支位置,为后续与近缘模式种的收集与比对提供了具体方向,通过文献查阅最终获得7个种[N.aotearoa,棒状拟盘多毛孢(N.clavispora),N.magna,N.australis,N formicarum,N.honoluluana和N.piceana]作为二次建树的模式种(表1)。近缘种分子系统发育分析结果表明,供试菌株SNHS12B与N.megna代表菌株处于同一分支,并与其他近缘种区分,且自展值支持率达到99%(图2)。根据分子系统发育分析结果表明该病原菌为N.megna。