《表1 用于构建系统进化树的菌株》
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《中国新记录Xylogone ganodermophthora的分离及鉴定》
注:模式菌株以加粗方式显示
ITS序列使用Bioedit7.1.11[5]进行编辑、BLAST进行序列比对、DAMBE7.0.5[6]进行序列饱和度检测。经BLASTn比对,从Gen Bank选取序列相似度90%以上已知菌株的ITS序列作为参考(表1),进行系统发育分析。应用Clustlax2.0[7]进行多重序列比对。Mr Modeltest2.3[8]选择最优核酸模型并计算相关参数。Mr Bayes3.1.2[9]构建系统发育树。以Sporendonema purpurascens(GenBank登录号:KACC41227)菌株ITS序列作为外群,建立4个马尔可夫链,运行两百万代,每100代抽样1次。舍弃25%老化样本,根据剩余样本构建一致树,计算后验概率。系统发育树使用TreeGraph2.14.0l[10]软件进行编辑。
图表编号 | XD0080478300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.01 |
作者 | 刘昆、郑巧平、蒋俊、吴志鹏 |
绘制单位 | 丽水市农业科学研究院、丽水市农业科学研究院、丽水市农业科学研究院、龙泉市农业局 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |