《表1 用于构建系统进化树的菌株及GenBank登录号》

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《茶轮斑病致病病原菌的鉴定》


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用Bioedit检测和拼接基因序列,拼接后的序列上传至美国国立生物技术信息中心(NCBI)进行比对,确定其属的划分。从GenBank中下载相关序列(表1),用Bioedit7.0.9.0和ClustalX 1.81将序列进行对齐(Alignment)以及必要的手工比对[20-21]。采用最大简约法(Maximum Parsimony,MP)[22]和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)[23]联合ITS、β-tubulin和tef1的扩增基因片段进行系统发育分析。