《表1 用于进化树构建的msh1序列基因登录号》

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《海南短指软珊瑚msh1基因的系统进化》

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短指软珊瑚属（Sinularia）在国际海洋物种网站登记有189种．目前，NCBI网站上的msh1基因序列20个种中，只查询到很少部分种的中文命名．这20个种的名称具体如表1所示．利用这20个Sinularia种的msh1基因序列构建进化树，见图1．选取的所有msh1基因种的碱基序列长度为735 bp，序列之间比对没有发现缺失和插入序列．从图1进化树的分支中可以看出S.notanda种分化时间最早；有6组（共12个种）Sinularia种msh1序列一致，这6组序列分别如下:S.ceramensis和S.polydactyla；S.crassa和S.finitima；S.flexibilis和S.querciformis；S.cruciata和S.humilis；S.abrubta和S.molesta；S.penghuensis和S.penghuensis．上述研究表明msh1标记基因不能够区分所有不同Sinularia种．