《表2 用于构建系统发育树的菌株》
注:*代表炭疽菌模式菌株,—表示GenBank中无相关数据。
将所获得序列进行Blast序列比对,幵提交到NCBI数据库,以确定病原菌的分类地位。选用Weir和Damm等[5-8]炭疽菌模式菌株或权威菌株的序列(表2)与本研究供试菌株共同构建系统进化树。采用Clustal X软件对表2中的菌株序列进行比对分析,需要时由BioEdit软件进行人工调整,按照ITS-ACT-GAPDH-TUB2-CAL的顺序进行首尾相连,以Monilochaetes infuscans(CBS869.96)和Colletotrichum fioriniae(CBS124958)作为外群[9],用MEGA 5.2软件以最大似然法(Maximum Likelihood)构建系统发育树。
图表编号 | XD0082426800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.10 |
作者 | 徐成楠、谭宴宾、迟福梅、冀志蕊、王娜、周宗山 |
绘制单位 | 中国农业科学院果树研究所、中国农业科学院果树研究所、中国农业科学院果树研究所、中国农业科学院果树研究所、中国农业科学院果树研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |