《表1 引物序列:凹大叶蝉线粒体全基因组序列分析及系统发育关系》

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《凹大叶蝉线粒体全基因组序列分析及系统发育关系》


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W=(A/T),Y=(C/T),N=(A/C/G/T),R= (A/G)

根据前人基于动物线粒体保守区域设计的简并引物,共选取9对引物(Simon,Beckbach,2006)(表1) ;同时参考数个近缘种叶蝉线粒体基因组序列的测序结果(Li et al.,2015;Zhou et al.,2014;Yu et al.,2017),发现所用引物覆盖了凹大叶蝉线粒体基因组的全部序列。引物由上海桑尼有限公司合成提供。PCR扩增体系15μL:10×PCR LA Taq Buffer(Mg2+plus)1.5μL,2.5 mmol/L的dNTP 2.4μL,10μmol/L的上下游引物各0.6μL,DNA 0.5μL,5 U/μL的LA Taq 0.15μL,ddH2O 9.25μL。PCR扩增参数:94°C预变性3 min;94°C变性15 s、56°C退火15 s、72°C延长3 min,40个循环;72°C终延长10 min。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,直接纯化或胶回收纯化后,送上海桑尼有限公司测序。