《表1 用于多位点系统发育分析的菌株》

《表1 用于多位点系统发育分析的菌株》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《与蝉花有关的虫草菌生物多样性的研究Ⅱ:重要药用真菌蝉花有性型的发现及命名》


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数据集包括30个分类单元的38个菌株(含外群及井冈山材料),157条DNA序列的6位点矩阵,其中ITS 723bp、LSU 911bp、SSU 1 295bp、RPB1 698bp、RPB2 1 016bp和TEF 968bp;序列总长度达5 611bp(表1),1 776个独特模式,其中3 696个恒定点,1 518个简约信息点,397个单碱基差异点。使用IQ-TREE(Minh et al.2020)软件包,采用最大似然法(Rehner&Buckley 2005),以肉座菌目丛赤壳科朱红丛赤壳Nectria cinnabarina作为外群,构建ML系统发育树。最大似然法用1 000次重复获得自举支持率,同时选用超快自展和1 000次SH-a LRT检验估算节点的可信度。经IQ-TREE计算,得到联合基因的贝叶斯信息准则(BIC)最适模型为:TIM3+F+G4。