《表1 用于多位点系统发育分析的菌株》
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《与蝉花有关的虫草菌生物多样性的研究Ⅱ:重要药用真菌蝉花有性型的发现及命名》
数据集包括30个分类单元的38个菌株(含外群及井冈山材料),157条DNA序列的6位点矩阵,其中ITS 723bp、LSU 911bp、SSU 1 295bp、RPB1 698bp、RPB2 1 016bp和TEF 968bp;序列总长度达5 611bp(表1),1 776个独特模式,其中3 696个恒定点,1 518个简约信息点,397个单碱基差异点。使用IQ-TREE(Minh et al.2020)软件包,采用最大似然法(Rehner&Buckley 2005),以肉座菌目丛赤壳科朱红丛赤壳Nectria cinnabarina作为外群,构建ML系统发育树。最大似然法用1 000次重复获得自举支持率,同时选用超快自展和1 000次SH-a LRT检验估算节点的可信度。经IQ-TREE计算,得到联合基因的贝叶斯信息准则(BIC)最适模型为:TIM3+F+G4。
图表编号 | XD00202418100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.22 |
作者 | 李增智、栾丰刚、HYWEL-JONES Nigel L、张胜利、陈名君、黄勃、孙长胜、陈祝安、李春如、谭悠久、董建飞 |
绘制单位 | 浙江泛亚生命科学研究院、安徽农业大学教育部真菌生物技术工程研究中心、江西农业大学林学院、浙江泛亚生命科学研究院、浙江泛亚生命科学研究院、亳州学院生物工程研究所、安徽农业大学教育部真菌生物技术工程研究中心、安徽农业大学教育部真菌生物技术工程研究中心、浙江泛亚生命科学研究院、浙江泛亚生命科学研究院、浙江泛亚生命科学研究院、浙江泛亚生命科学研究院、浙江泛亚生命科学研究院 |
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