《表1 用于系统发育分析的芸薹腐霉及其相关腐霉菌株》

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《大白菜腐霉根腐病的病原》

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分别选用引物ITS（ITS1和ITS4）、coxⅠ（Oom Cox I-Levup和FM85mod）（Stanghellini et al.2014） 进行病原菌相应序列的扩增。扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后，由生工生物工程（上海）有限公司进行纯化和双向测序，测序结果经Sequencher5.0软件自动装配后导出重叠群（Contig），并在NCBI（http://www.ncbi.nlm.gov）数据库中进行BLAST分析后提交给GenBank。再从GenBank中选取相关菌株的ITS和coxⅠ序列（表1），参照Stanghellini et al.（2014）方法，使用两种序列联合建树。用Clustal X 1.83软件分别对序列进行比对，比对参数为两两序列比对参数（gap opening=10，gap extension=0.1）及多重序列比对参数（gap opening=10，gap extension=0.2，transition weight=0.5，delay divergent sequences=30%）。运用软件PAUP*4.0b10，采用最大简约法（maximum parsimony，MP）构建系统发育树。以Phytophthora nicotianae为外群。