《表1 实验中所用引物信息》

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《一例异育银鲫(Carassius auratus gibelio)暴发性出血病病原分析》


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分别提取自然发病鱼、人工感染鱼、健康鱼组织以及感染CGB细胞的DNA,使用NanoDrop ND 2000测定DNA的浓度及纯度。CyHV-2的PCR检测方法参照文献(Goodwin et al,2006a;Jeffery et al,2007;Waltzek et al 2009;Sahoo et al,2016)的方法进行,根据世界动物卫生组织(OIE)上推荐引物(TK)用于检测CyHV-3,引物信息见表1。反应体系为50μL:DNA1μL,上下游引物(10μmol/L)各0.5μL,GoTaq?Master Mixes 25μL,灭菌超纯水23μL。扩增反应热循环参数为:95oC 2min,95oC 30s,退火30s(温度参照表1),72oC 30s,30个循环;72oC延伸10min。取5μL PCR产物在1%的琼脂糖凝胶中电泳观察结果。选取编号1—3的引物阳性扩增产物送南京金斯瑞公司测序,测序结果通过NCBI的Blast检索系统进行序列同源性分析。系统进化树依据DNA聚合酶基因部分氨基酸序列绘制,将测得的聚合酶基因序列翻译为氨基酸序列,并与GenBank数据库中其他疱疹病毒代表种的DNA聚合酶基因的氨基酸序列进行比较分析,多重比对采用ClustalW软件,用MEGA 7.0构建系统发育树。