《表1 实验中所用引物信息》
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《一例异育银鲫(Carassius auratus gibelio)暴发性出血病病原分析》
分别提取自然发病鱼、人工感染鱼、健康鱼组织以及感染CGB细胞的DNA,使用NanoDrop ND 2000测定DNA的浓度及纯度。CyHV-2的PCR检测方法参照文献(Goodwin et al,2006a;Jeffery et al,2007;Waltzek et al 2009;Sahoo et al,2016)的方法进行,根据世界动物卫生组织(OIE)上推荐引物(TK)用于检测CyHV-3,引物信息见表1。反应体系为50μL:DNA1μL,上下游引物(10μmol/L)各0.5μL,GoTaq?Master Mixes 25μL,灭菌超纯水23μL。扩增反应热循环参数为:95oC 2min,95oC 30s,退火30s(温度参照表1),72oC 30s,30个循环;72oC延伸10min。取5μL PCR产物在1%的琼脂糖凝胶中电泳观察结果。选取编号1—3的引物阳性扩增产物送南京金斯瑞公司测序,测序结果通过NCBI的Blast检索系统进行序列同源性分析。系统进化树依据DNA聚合酶基因部分氨基酸序列绘制,将测得的聚合酶基因序列翻译为氨基酸序列,并与GenBank数据库中其他疱疹病毒代表种的DNA聚合酶基因的氨基酸序列进行比较分析,多重比对采用ClustalW软件,用MEGA 7.0构建系统发育树。
图表编号 | XD0066093800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 袁雪梅、潘晓艺、郝贵杰、刘莉、吕孙建、蔺凌云、沈锦玉 |
绘制单位 | 农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江省淡水水产研究所、农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江省淡水水产研究所、农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江省淡水水产研究所、农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江省淡水水产研究所、农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江省淡水水产研究所、农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室浙江省鱼类健康与营养重点实验室浙江 |
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