《表1 本实验所用引物信息》

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《玉米矮花叶病毒分离物基因组克隆及多样性分析》


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注:引物位置为该引物在参考基因组中起始位点。

从NCBI获得8个玉米中分离得的SCMV基因组完整序列(序列号分别为:AJ001691.1、KM025045、KM025043.1、JQ403609.1、AM110758.1、AJ310198.1、KT895080.1、AY569692.1),通过DNAMAN 6.0进行保守区预测与分析。经过多重比对,截成等长片段,在其保守区域通过Premier5.0设计了11对引物(表1),分别用于扩增SCMV开放阅读框(open reading frame,ORF)和非翻译区(5'-UTR和3'-UTR)。基因组5'-UTR和3'-UTR端利用Race试剂盒扩增(TaKaRa,Japan)。