《表3 SCMV各个基因选择压力分析》

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《玉米矮花叶病毒分离物基因组克隆及多样性分析》


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注:m:序列数量;S:分离为点数;Ps为分离位点数与总位点数比值;θ为Ps与参数a1比值;π:核苷酸多样率;Ks同义突变;Ka为非同义突变;Tajima‘s D、Fu&Li'D和Fu&Li'Fi为中性检测。

利用DNASP 5.0软件统计了27个SCMV的10个蛋白Ks和Ka值,通过计算Ka/Ks证实,P1和CP蛋白Ka/Ks>1,即受正向选择,通过比对P1和CP蛋白的氨基酸序列,发现该位点非常保守。Hc-Pro、P3、6K1、CI、6K2、Nia-Vpg、Nia-Pro与Nib蛋白Ka/Ks<1,且全基因组Ka/Ks<1,即Ka