《表4 基于UPGMA、NJ法构建进化树的平均节点支持率和多序列同质性检验》

《表4 基于UPGMA、NJ法构建进化树的平均节点支持率和多序列同质性检验》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《应用于多个沉香属物种鉴定的DNA条形码序列筛选》


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注:1)括号中数值-节点支持率≥70的节点数百分比

基于UPGMA和NJ法两种方法,分析单一片段和多序列片段组合构建进化树平均节点支持率的情况(表4)。其中无论是UP-GMA还是NJ法,单一片段构建进化树的平均节点支持率都比多序列片段组合构建进化树的平均节点支持率低。两种方法构建进化树平均节点支持率较高的组合均为mat K+ITS2、mat K+rbc L、mat K+ITS2+rbc L、mat K+ITS2+trnH-psbA、matK+rbcL+trnH-psbA和matK+ITS2+rbcL+trnH-psbA,同质性检验也表明这些组合构建进化树均呈现显著关系(P<0.05),并适用于进化树构建。其中,mat K+ITS2+rbcL和matK+ITS2+rbcL+trnH-psbA建树效果最佳,matK+ITS2+rbc L基于UPGMA法构建进化树的平均节点支持率为58.60(53.33%),NJ法构建进化树的平均节点支持率为56.47(53.33%);同理可知,mat K+ITS2+rbc L+trn H-psbA组合UPG-MA法为59.67(53.33%),NJ法为54.27(53.33%)。综合比较而言,最终选择mat K+ITS2+rbc L组合构建多个沉香属物种进化树。