《表4 人TCF7L2基因启动子区SNP预测》

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《人TCF7L2基因启动子生物信息学分析》

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注解:NA:无法预测。

在F-SNP软件中输入人TCF7L2基因5'上游1～2 000 bp的染色体位点（Chr 10:112 948 407～112 950 406），检索到2个SNP:rs11195470、rs7083546（见表4）。用SNP Function Prediction软件进行功能预测和种族特异等位基因频率查询。结果显示:rs11195470、rs7083546保守性极低，在4种人群中rs11195470等位基因频率有种族差别，北欧西欧血统的美国人rs11195470等位基因频率最高，日本人和尼日利亚人等位基因频率相同（表5）。为了探讨rs11195470、rs7083546多态性对转录因子结合的影响，用Ali Baba2.1软件对SNP所在序列进行转录因子结合位点预测，结果如表6。