《表3 3 个群体猪TNF-α基因启动子区基因型频率及SNP分析》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区多态性与其血清含量的关联分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

选取TNF-α基因启动子G-1256、G-1239位点区作为研究对象，通过HRM方法对3个不同遗传背景猪群体进行基因型检测。Gene scaning分析结果显示3个群体猪中该区域基因型主要分为4种类型，依次命名为AA、BB、CC和DD（图2），且3个群体猪的该区域基因型频率存在明显差异。其中CC基因型在3个猪群体中均表现为优势基因型，尤以野杂猪群体CC基因型频率最高，达73%（22/30），民猪群体次之，达52%（13/25），大白猪最低，仅31%（9/29）（表3） 。将PCR产物测序分析，结果显示BB和CC基因型个体为纯合型，G-1256位点均为G，G-1239位点分别是G和A，DD基因型G-1239位点为A/G双峰，表明DD基因型为BB、CC基因型的杂合型。AA基因型则相对复杂，其在G-1256和G-1239位点均表现为A/G双峰（图2）。由于该区域基因型由2个SNP组成，结合测序结果显示3个群体中该区域实际上存在3种单倍型（Haplotype），即:GG、GA和AG。但鉴于AA基因型个体数量稀少且仅在大白猪群体中存在，推测G-1256A可能在大白猪品种培育过程中通过突变产生了新的多态位点。由于不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区基因型种类与频率的差异性，提示自然状态下该区域可能承受较大的环境选择压力。