《表2 五款转录因子预测软件预测的结果 (交集)》

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《大鼠Neuritin基因启动子区克隆、鉴定及生物信息学分析》


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依据上述以上的分析结果,进一步利用五款转录因子分析软件(Promoter scan,Ali Baba2.0,TRBIND,Match 1.0 Public和TFSEARCH)对大鼠Neuritin基因5'调控区1100 bp的核心启动子区域进行转录结合位点生物信息学分析,我们采用严苛的求五种预测软件预测结果的交集的方法,最终筛选出与Neuritin基因启动相结合的候选转录因子。对于预测得出交集的转录因子结合位点,进一步将这些位点序列与小鼠和人的序列进行比较,将转录因子结合位点同源性高的转录因子作为最终候选转录因子结合位点。结果显示共筛选出CREB,AP-1,GATA-1,AP-2,AP-4,RAP1,MCM1和Pit八个转录因子(表2)。