《表2 五款转录因子预测软件预测的结果 (交集)》
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《大鼠Neuritin基因启动子区克隆、鉴定及生物信息学分析》
依据上述以上的分析结果,进一步利用五款转录因子分析软件(Promoter scan,Ali Baba2.0,TRBIND,Match 1.0 Public和TFSEARCH)对大鼠Neuritin基因5'调控区1100 bp的核心启动子区域进行转录结合位点生物信息学分析,我们采用严苛的求五种预测软件预测结果的交集的方法,最终筛选出与Neuritin基因启动相结合的候选转录因子。对于预测得出交集的转录因子结合位点,进一步将这些位点序列与小鼠和人的序列进行比较,将转录因子结合位点同源性高的转录因子作为最终候选转录因子结合位点。结果显示共筛选出CREB,AP-1,GATA-1,AP-2,AP-4,RAP1,MCM1和Pit八个转录因子(表2)。
图表编号 | XD0074199000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.01 |
作者 | 李琼琼、王立民、徐梦思、万科幸、黄瑾、王成坦、毛福秀、高蕊 |
绘制单位 | 石河子大学医学院、新疆地方与民族高发病教育部重点实验室、新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室、新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室、石河子大学医学院、新疆地方与民族高发病教育部重点实验室、石河子大学医学院、新疆地方与民族高发病教育部重点实验室、石河子大学医学院、新疆地方与民族高发病教育部重点实验室、石河子大学医学院、新疆地方与民族高发病教育部重点实验室、石河子大学医学院、新疆地方与民族高发病教育部重点实验室 |
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