《表1 青稞Ht LTP1蛋白信号肽分析》

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《青稞HtLTP1基因的克隆与表达分析》


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注:Max.C:原始剪切位点;Max.S:信号肽;Max.Y:综合剪切位点;Mean S:从N端氨基酸开始到剪切位点处各氨基酸的平均S值;D:Mean S和Max.Y分值的加权平均值

HtLTP1蛋白的平均信号肽最大得分值为0.931,表明该蛋白存在信号肽(表1)。而且HtLTP1的信号肽为26个氨基酸,与nsLTP1家族成员N端具有典型21~27个的信号肽结构的基本特征相符合。利用TMHMM进行跨膜区分析,结果显示HtLTP1基因编码蛋白含跨膜区,为跨膜蛋白。亚细胞定位分析发现,细胞壁中的可能性为44.4%,在细胞核中的可能性为44.4%,而在线粒体中可能性为11.1%,推测蛋白有较大概率定位在细胞壁和细胞核中。