《表2 榛子SPL蛋白序列保守基序预测》

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《榛子SBP基因家族鉴定及其系统进化和表达分析》

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为进一步明确该基因家族各成员的系统进化关系，本研究选择拟南芥、毛果杨SBP基因家族成员用来构建系统发育树．结果显示，系统进化树主要可以分为5大组别（GroupⅠ、GroupⅡ、GroupⅢ、GroupⅣ和GroupⅤ）（见图2），各物种在不同组别中均有基因家族成员分布．其中Ch SPL7属于GroupⅠ，ChSPL1、ChSPL2和ChSPL8属于GroupⅡ，ChSPL3和ChSPL9属于GroupⅢ，ChSPL10属于GroupⅣ，ChSPL4、ChSPL5和ChSPL6属于GroupⅤ．通过MEME在线工具对蛋白序列保守基序分析，结果显示，榛子SPL蛋白均含有“SBP”结构域（见图3(A）)，同时得到8种保守基基序（见表2），其中Motif 1序列与“SBP”结构域序列相重合（见图3(B）和3（C）)．同时，发现在不同蛋白序列中其保守基序分布类型和数量差异较大，但均含有Motif 1，其中ChSPL4、ChSPL6和ChSPL10只含有1个保守基序（Motif 1），而ChSPL1则含有6个保守基序（Motif 1、Motif 3、Motif 4、Motif 6、Motif 7和Motif 8）；且除Motif 1外，Motif 3是分布最多的保守基序，分布于4条蛋白序列中，分别为ChSPL1、ChSPL2、ChSPL7和ChSPL8（见表2）；该结果进一步证明SBP结构域对于保证该基因家族功能性具有重要作用，且其他保守基序的差异分布是各基因家族成员功能存在差异的原因之一．