《表3 英那河9个水体样品的序列数、有效序列数OTU数及覆盖度》

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《英那河细菌群落结构及其与环境因子的相关性研究》


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为研究样品物种组成多样性,对所有样品的有效序列进行聚类,以97%的一致性将序列聚类成操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU).英那河9个水样测序所得的序列数、有效序列数、OTU数见表3.在所有样品中都获得了60 000条以上的序列,优化处理后得到50 000条以上的有效序列,将得到的高质量序列以97%相似度划分,得到483~964个OTU.有效序列数最少的为7月份的入海口断面,共51 352条,有效序列最多的为9月份的入海口断面共70 653条.OTU数最少的为7月份的入海口断面共483个,OTU数最多的为5月份的白堡子断面共964个.