《表2 各组样品有效序列与OTU数量统计》

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《基于高通量测序的大黄鱼表面微生物群落组成及变化分析》

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单样本多样性分析（Alpha多样性）反映微生物群落的丰度和多样性，各组样品中Alpha多样性指数如表2所示。其中，Chao1指数和ACE指数主要用于表征样本中的菌群丰度（Community richness)，Chao1指数越大，表示物种种类越多，ACE值越大，样本的真实物种种类越多；Shannon和Simpson指数主要用于表征样品中菌群多样性（Community diversity)；Coverage是指各样本中低丰度OTU的覆盖率，其数值越高，则样本中序列被测出的概率越高，直接反映测序结果是否代表样本中微生物的真实情况[33，34]。由表3结果可知，各组样本的测序覆盖率（Coverage）均在0.99以上，说明测序对样本中细菌的覆盖率高、测序深度适合，可满足各组样品中细菌多样性分析的需要[35]。