《表1 各组样品粪便菌群的OTU数量及Alpha多样性》

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《高通量测序技术研究鱼腥草酵素对小鼠肠道菌群的影响》

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利用Mothur软件对每个样品的OTU数量（相似水平97%以上）进行计算，OTU数量可以代表样品物种的丰度[10]。由表1可知，在所有样品中，样品OTU数量最多的为鱼腥草酵素C3组（446），最少的为生理盐水B3组（389），这表明小鼠粪便中菌群丰度存在差异。其中，样品中菌群多样性指数最高的为鱼腥草酵素C2组（ACE值472.003 6和Chao值471.794 1最高），最低的为生理盐水B3组（ACE值408.633 0和Chao值406.531 3最低）。同时，Alpha多样性分析也表明，给小鼠灌胃鱼腥草酵素后，其肠道菌群的多样性高于水果酵素组和生理盐水对照组，且鱼腥草酵素组的粪便菌群丰度最高。Shannon指数越大，表示群落多样性越高，9组样品中以鱼腥草酵素组C3的Shannon值最大（4.612 270），水果酵素组S2次之。Simpson值越低表示群落多样性越高，鱼腥草酵素组C3的Simpson值在9组样品中最小（0.019 000），其次为水果酵素组S2的Simpson值，为0.026 708。Coverage指数是样品的测序深度也表明样品的覆盖率，9个样品的Coverage指数均在0.89以上，表明样品中序列未被检测到的可能性较低。各组样品粪便菌群的OTU数量及Alpha多样性说明，3个鱼腥草酵素组小鼠粪便的菌群多样性最高，鱼腥草酵素对小鼠的肠道菌群具有一定的调整作用，且作用效果最为突出。