《表3 黄海7个样品基于OTU指数的Alpha多样性分析》

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《刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能》

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黄海样品测序覆盖率为95%～98%，表明实验样本中序列没有被测出的概率较低。在OTU水平上生成的黄海海区的7个样品稀释曲线皆趋于平坦（图1），说明测序深度足够反映样本的多样性。黄海海区7个样品的有效序列经进一步分析可归为1908～5522个OTU（表3）。通过Chao1和Ace指数可估计刺参肠道和养殖环境群落丰度，通过Shannon和Simpson指数可估计样本群落多样性。7个样品中ACE和Chao1多样性指数分别是水样2842.45和2533.32，底泥样品7577.51～7913.43和7114.87～7296.84，海参肠道样品3901.3～4269.57和3198.14～3437.48；Shannon和Simpson指数分别是水样4.09和0.060，底泥样品6.60～6.95和0.004～0.010，海参肠道样品5.31～5.43和0.01～0.02。表明各样品中底泥样品的丰富度与多样性均高于水样和刺参肠道样品，而三类样品中水样的丰富度与多样性最低。