《表4 渤海4个样品基于OTU指数的Alpha多样性分析》

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《刺参肠道及养殖环境菌群结构与功能》


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渤海海区测序样品的覆盖率为96%~98%,则表明样本中序列没有被测出的概率较低。由样品稀释曲线分析(图2),曲线区域平坦,测序数据合理,物种丰富度较高。4个样品有效序列经进一步分析可归为1379~3939个OTU(表4)。4个样品中ACE和Chao1多样性指数分别是水样品3546.87和2459.59,底泥样品5473.9和5197.4,肠道样品3059.18、3273.25和3018.06、3157.97;Shannon和Simpson指数分别是水样3.81和0.08,底泥样品6.63和0.005,海参肠道5.28、5.44和0.02、0.02。各样品中底泥样品的丰富度与多样性度均高于水样和刺参肠道样品,而三类样品中水样的丰富度与多样性最低。