《表2 共有的保守基序序列》
将玉米AMT基因的氨基酸序列导入Geneious软件,对其蛋白的等电点(PI)、分子量(MW)以及氨基酸的数目(aa)进行分析。结果表明,Zm AMT-1,Zm AMT-3,Zm AMT-4,Zm AMT-6和Zm AMT-7的氨基酸序列较为相近,而Zm AMT-2,Zm AMT-5和Zm AMT-8的氨基酸序列具有相似的保守基序的种类和数目。利用相关软件对玉米AMT基因的氨基酸序列进行比对和保守motif的分析(图3),其共同存在的motif序列见表2。其中motif1,2,3,4,5,8出现在所有的AMT序列中,motif10,11,13,14,17,18,19只出现在Zm AMT-2,Zm AMT-5和Zm AMT-8中,motif6,7,9,12只出现在Zm AMT-1,Zm AMT-3,Zm AMT-4,Zm AMT-6和Zm AMT-7中,而motif15,16,20比较特别,分布没有规律;可知不同类型的AMT基因在motif数目和种类是有所区别的,初步推断Zm AMT-2,Zm AMT-5和Zm AMT-8及Zm AMT-1,Zm AMT-3,Zm AMT-4,Zm AMT-6和Zm AMT-7两组成员几乎含有相同的保守基序,其位置分布也较为保守。
图表编号 | XD00187483000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.03.15 |
作者 | 李红梅、韩国民 |
绘制单位 | 安徽新华学院信息工程学院、安徽农业大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |