《表2 甜橙bHLH基因的保守基序》

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《甜橙bHLH转录因子家族的鉴定及生物信息学分析》

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通过多序列比对和SMART分析发现，甜橙126个蛋白序列均含有bHLH结构域。根据鉴定出的甜橙CsbHLH基因的保守结构域序列，构建甜橙系统进化拓扑图，得到的结果与图2中所示的进化关系是基本一致的。甜橙bHLH保守基序进行分析结果如图3所示，每一个亚家族之间的转录因子尽管它们的长度差别很大，但是它们的保守基序长度及位置都很相似。motif1-10在图中用不同的颜色表示，10个保守基序的详细信息如表2所示。除bHLH保守结构域外，bHLH转录因子家族还含有其他保守型的结构域，但Motif1和Motif2总是相邻，两者共同构成了bHLH结构域。这些保守元件是转录因子发挥其调控作用所必需的，对于维持蛋白质的三维构象和与靶基因的结合至关重要。