《表4 基孔肯雅病毒分离株的保守基序分析》

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《浙江省首次分离基孔肯雅病毒全基因序列特征分析》

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不同基孔肯雅病毒分离株的3′UTR的同源性较低，但RNA二级结构预测分析发现，所有12个毒株的3′UTR区域有多个保守的茎环结构（stem-loop），如在11 339~11 357 nt位置的茎环结构，且环部分的序列组成均为C（n）UA（n）GA（图1）。另外，茎环结构的环形部分存在多个保守的基序（motif）（表4） 。