《表3 Arifa S.Khan等人提出的泡沫病毒分离株的命名法》

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《泡沫逆转录病毒分类和命名的最新进展》


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Arifa S.Khan等[12]提出一种类似应用于猴免疫缺陷病毒和猴嗜T淋巴细胞病毒分离株的泡沫逆转录病毒命名法。所有的泡沫逆转录病毒命名是在分类词语“泡沫病毒”前面为宿主名称(例如,牛科动物,猫科动物,猿猴类),后面跟着特定宿主的物种名称,或者在某些情况下是某些特定物种的亚种名称。病毒宿主名称和“泡沫病毒”缩写为大写字母(例如,猫泡沫病毒缩写为FFV,猴泡沫病毒缩写为SFV),随后是宿主物种名称的三个小写字母缩写。这些缩写由宿主属的首字母和物种或亚种的前两个字母组成,例如:台湾猕猴泡沫病毒(Simian foamy virus Macaca cyclopis)简写为SFVmcy。当字母相同时,用物种或亚种的第一个字母和下一个不同的字母表示。例如:从新世界灵长类物种分离的猴泡沫病毒,金头狮面狨(Leontopithecus chrysomelas)和黑狮面狨(Leonthopithecus chrysopygus)分别缩写为SFVlcm和SFVlcp)。在未知宿主物种的情况下,用属名的第一个字母后面跟着“xx”(斜体字母)表示。通过使用病毒缩写后跟一个下划线,并在该下划线后紧跟其分离鉴定信息,如其分离宿主、隔离标识及其他识别信息来表示泡沫病毒分离株的名称。例如,从家猫(Felis catus)中分离得到的猫泡沫病毒毒株FUV7将被命名为FFVfca_FUV7(表3)。类似地,在涉及非人灵长类动物的物种间传播的情况下,从野生西非黑猩猩亚种(Pan troglodyes verus)中分离的来自西方红疣猴(Philiocolobus badiusbadius)的SFV将被指定为SFVpba_pveLeo[27]。此外,对于重组病毒(包括天然存在的和那些基因工程改造的重组病毒),最后在其名称后加“[RF]”(例如,SFVmcy_FV34[RF])[28]。