《表1 参考毒株信息:兔出血症病毒镇江株的分离鉴定及VP60蛋白活性表达》

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《兔出血症病毒镇江株的分离鉴定及VP60蛋白活性表达》


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根据已公布的RHDV基因组序列(GenBank登录号:HQ917923),利用Primer Premier 5.0软件设计VP60基因扩增特异性引物,引物序列为:上游引物VP60-F:下划线处分别为BglⅡ和SalⅠ酶切位点。按照RNA提取试剂盒、SuperScriptⅢ反转录酶说明书提取病毒基因组并进行反转录合成cDNA,并以此为模板进行PCR扩增。PCR反应体系20μL:2×Phusion高保真PCR Mix 10μL,上、下游引物(10μmol/L)各1μL,cDNA 2μL,超纯H2O 6μL。PCR反应条件:98℃预变性30s;98℃变性10s,55℃退火20s,72℃延伸30s,共30个循环;72℃延伸10min。将PCR扩增产物送生工生物工程(上海)股份有限公司测序。将获得的序列与参考毒株进行同源性比对分析,并绘制系统进化树。参考毒株信息见表1。