《表2 LcXTH蛋白保守基序及功能注释》

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《基于转录组的荔枝XTH家族基因的鉴定及分析》


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进一步利用在线软件MEME数据库对LcXTH蛋白中的保守基序进行预测分析,结果表明:预测Lc XTH基因家族中包含10个保守基序(图2),但LcX-TH基因家族成员间存在保守基序种类及数目存在的差异。其中LcXTH2、LcXTH4、LcXTH5、LcXTH6、LcXTH7、LcXTH12、Lc XTH13不含Glyco_hydro_16保守结构域,其他均含有Glyco_hydro_16保守结构域。LcXTH2、LcXTH3、LcXTH4、LcXTH8、LcXTH10、LcXTH13、LcXTH14、LcXTH16、LcXTH22不含基序2。不同LcXTH所包含的差异基序表明XTH可能具有不同的生物化学特征和生物学功能。利用在线Pfam软件对得到的10个保守基序进行功能注释(表2),结果表明基序1、基序3、基序4为Glyco_hydro_16;基序2为XET_C,其余的6个基序没有对应的注释,功能未知。