《表3 GA20ox保守基序注释》

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《毛竹茎秆伸长过程中赤霉素生物合成、降解和信号转导关键基因的鉴定及表达分析》


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GA20ox和GA3ox家族基因调控赤霉素生物合成,对植物细胞中的赤霉素积累起着关键作用。它们都是由小基因家族编码,在不同的物种中有着各自的保守基序。图1为GA20ox蛋白家族在拟南芥、水稻和毛竹的进化树,显示各个基因在这3个物种中都比较保守,而毛竹与同为禾本科的水稻亲缘关系更为接近。其中PhGA20ox4、PhGA20ox6、PhGA20ox7、PhGA20ox8这4个蛋白序列的保守性比较低,并且MEME的基序搜索结果显示这4个基因的序列长度更短并且有保守基序的缺少现象。Motif 1、Motif 2和Motif 9在各个物种中高度保守,其中包含了与GA底物结合有关的LPWKET基序、H和D残基等(图1,表3)。