《表1 向日葵Hsp70基因家族成员所编码蛋白的理化性质》

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《向日葵Hsp70基因家族成员的全基因组鉴定与生物信息学分析》

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注:E:内质网；C:细胞质；Ch:叶绿体；M:线粒体；N:无

使用Hsp70种子文件PF00012进行BlastP同源性搜索，共得到103个Hsp70基因家族成员，其编码区长度分别在63～1 267个氨基酸之间（表1）。其中以HaHsp70-28编码的蛋白序列（OTG32169）最长，为1 267个氨基酸；而HaHsp70-69所编码的蛋白质序列（OTF95125）最短，仅有63个氨基酸。基因分子量的变化与Hsp70氨基酸长度的变化基本相对应，含有最大分子量是HaHsp70-28（OTG32169），达到了140 012.89 kD；而最小分子量的是HaHsp70-69（OTF-95125），为6 966.27 kD。等电点的变化范围相对来说比较小，大多数的Hsp70蛋白等电点均分布在5～10之间（表1），其中具有最高等电点的是HaHsp70-18（OTF96984），达到了9.64，HaHsp70-89（OTG11656）等电点最低，仅有4.50。全部成员的总平均亲水性多数为负值，即绝大部分为疏水蛋白，且数值变化范围不大，其中仅有8个基因的总平均亲水性为正值，即为亲水蛋白，它们分别是HaHsp70-3（OTG16602）、HaHsp-70-9（OTF92421）、HaHsp70-48（OTF88157）、HaHsp70-49（OTF88126）、HaHsp70-66（OTF95124）、HaHsp70-69（OTF95125）、HaHsp70-75（OTF94608）以及HaH-sp70-90（OTG11657）。这些家族成员的亚细胞定位，位于细胞质的蛋白最多，有46个；其次是内质网，有31个；而叶绿体和线粒体较少，均各有5个，此外，还有16个基因没有确定亚细胞定位（表1）。