《表1 芒果bHLH家族蛋白的识别、理化性质及二级结构分析Tab.1 Identification, physicochemical properties and secondary structur
基于从Pfam 31.0数据库下载的种子文件PF00010和PF14215,使用HMMER 3.1b2软件从芒果转录组49 117个蛋白序列中分别筛选出211个和86个候选蛋白序列,逐个进行结构域及同源比对分析,去除重复及非全长氨基酸序列,共获得87个芒果bHLH家族蛋白序列(表1),其中最小的bHLH蛋白含89个氨基酸,最大的bHLH蛋白含944个氨基酸。
图表编号 | XD0056169300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.25 |
作者 | 郑斌、文定青、武红霞、邹明宏、刘恒、王松标、赵巧丽 |
绘制单位 | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所、国家热带果树种质资源圃、农业农村部热带果树生物学重点实验室、中国热带农业科学院南亚热带作物研究所、国家热带果树种质资源圃、农业农村部热带果树生物学重点实验室、中国热带农业科学院南亚热带作物研究所、国家热带果树种质资源圃、农业农村部热带果树生物学重点实验室、中国热带农业科学院南亚热带作物研究所、国家热带果树种质资源圃、农业农村部热带果树生物学重点实验室、中国热带农业科学院南亚热带作物研究所、国家热带果树种质资源圃、农业农村部热带果树生物学重点实验室、中国热带农业科学院南 |
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